在Linux下安装配置MPICH2.1.4[Linux安全]

　　本篇介绍MPICH2在Linux系统上的基本安装配置历程,假定一共有两台机械,辨别命名为node1和node2.

　　1. 安装预备

　　(1)设置主机名

　　先在/etc/hosts中删除本来的hostname,然后 vi /etc/hostname改成你想要的,注意必须顶行写.然后利用hostname号令来重新得到hostname, logout一下再login就会改掉.

　　(2)改正hosts文件

　　Ifconfig 得到本机的ip

　　node1的ip(192.168.1.1) node1 server

　　#个人认为这里的server加不加都可以就只是一个名字

　　node2的ip(192.168.1.2) node2

　　(3)配置自动ssh登录

　　配置自动ssh登录,即受权让node1和node2可以无密码的ssh登录对方以及自己,在node1和node2上运行ssh-keygen号令来产生公匙和私匙,辨别把公匙内容增添到本机和对方机的~/.ssh/authorized_keys.

　　具体做法:

　　$ ssh-keygen -t rsa,之后一路回车,这一步将产生~/.ssh目录,以及两个文件d_rsa(私钥)和 id_rsa.pub(公钥)

　　$ cd ~/.ssh

　　$ cat id_rsa.pub 》 authorized_keys 把node1的公匙存到本地authorized_keys

　　$ scp node1:~/.ssh/id_rsa.pub node2:~/.ssh/1.pub 把node1的公匙复制到node2

　　$ ssh node2登录到node2

　　$ ssh-keygen -t rsa在node2上产生一对公匙和私匙

　　$ cd ~/.ssh

　　$ cat id_rsa.pub 》 authorized_keys 把node2的公匙保存到本地authorized_keys

　　$ scp node2:~/.ssh/id_rsa.pub node1:~/.ssh/2.pub 把node2的公匙复制到node1

　　$ cat 1.pub 》 authorized_keys 把node1的公匙加入到node2的authorized_keys

　　$ ssh node1 登录到node1

　　$ cd ~/.ssh

　　$ cat 2.pub 》 authorized_keys 把node2的公匙加入到node1的authorized_keys

　　这里要保证authorized_keys的文件权限为600大概644:chmod 600 authorized_keys

　　这样在两台电脑之间辨别ssh登录过一次今后就可以无密码登录了.

　　注:另一种简便办法

　　A) 在node1上履行 ssh-keygen -t rsa,将产生~/.ssh目录,以及两个文件d_rsa(私钥)和 id_rsa.pub(公钥)

　　B) 在node1上履行cat id_rsa.pub 》 authorized_keys,把node1的公匙存到本地authorized_keys

　　C) 履行scp -R node1:~/.ssh/ node2:~/ 把node1的.ssh目录复制到node2 的home目录下

　　D) 在node1履行ssh node2,然后在从node2履行ssh node1,输入几个“yes”就完成了.

　　2. 安装MPICH2

　　从官网http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/index.php下载mpich2的最新版本mpich2-1.4.1p1.

　　(1)成立目录并解紧缩

　　首先成立一个目录,将mpich安装到这个文件夹下

　　mkdir mpich2

　　在得到mpich2-1.4.1之后

　　A) 将gzip紧缩的文件解压:mpich2-1.4.1p1.tar

　　gzip –d mpich2-1.4.1p1.tar.gz

　　B) 将tar归档的文件解开

　　tar xvf mpich2-1.4.1p1.tar

　　C) 进入mpich2-1.4.1p1的目录

　　cd mpich2-1.4.1p1

　　(2)配置、编译

　　A) 运行shell程序configure对mpich举行一些配置,利用smpd作为pm

　　./configure --prefix=/home/walter/mpich2 --with-pm=smpd --disable-f77 --disable-fc

　　B) 编译和安装

　　make

　　make install

　　注:在配置之前,要设置好系统时间,不然就会呈现以下错误:

　　pm的配置非常重要,安装时默许利用hydra 作为pm,而windows利用 smpd作为pm.因为对hydra不理解,假如配置时不指定pm,就会呈现单机可以精确履行,而多机直接无法通信的问题.如:

　　Fatal error in MPI_Send: Other MPI error, error stack:

　　MPI_Send(173)……: MPI_Send(buf=0x2aa59cd5b8, count=70920, MPI_INTEGER, dest=0, tag=2, comm=0x84000001) failed

　　MPIDI_CH3i_Progress_wait(214)……: an error occurred while handling an event returned by MPIDU_Sock_Wait()

　　MPIDI_CH3I_Progress_handle_sock_event(420):

　　MPIDU_Socki_handle_read(633)……: connection failure (set=0,sock=11,errno=104:Connection reset by peer)[cli_14]: aborting job:

　　Fatal error in MPI_Send: Other MPI error, error stack:

　　(3)设置环境变量

　　将安装后MPICH2的bin目录“mpich2”增添到系统途径中

　　Sudo vi /ect/environment 在PATH背面加上/home/yourname/mpich2/bin

　　然后echo $PATH,看看有没有增添成功.再下一步which smpd,看看有没有找到呼应的途径.

　　3. 启动与测试

　　(1)启动smpd

　　smpd –s

　　要求passphrase的值在全部节点上相等,因为在windows上也是用这个服务,所以可以实现,windows和linux的互联.

　　(2)实行历程及后果

　　我们操纵MPICH2的示例程序举行测试,示例为计算圆周率,可以输入精度.

　　A) 启动smpd:

　　smpd -s

　　B) 新建文件machinefile,内容为

　　node1

　　node2

　　C) cd mpich2-1.4.1p1

　　D) 履行

　　单节点履行

　　mpiexec –n 10 ./examples/cpi(n表示进程数)

　　多节点履行

　　mpiexec -n 10 -machinefile machinefile ./examples/icpi